É uno dei più antichi luoghi di culto della cristianità. Tutto iniziò, secondo la leggenda, nel 493, quando l'arcangelo Michele apparve qui, in una grotta. Un secolo più tardi i duchi longobardi di Benevento eressero sul posto una chiesa e Monte Sant'Angelo divenne meta di continui pellegrinaggi. Il santuario - più volte ampliato, trasformato e abbellito - è sormontato dal campanile ottagonale innalzato nel 1274 per ordine di Carlo I d'Angiò. L'interno, ricavato direttamente nella roccia, si compone di una sala a navata unica d'epoca angioina e della vasta grotta dell'Arcangelo. Al fondo della cavità si staglia la statua marmorea dedicata a San Michele, opera attribuita ad Andrea Sansovino. Di notevole interesse anche la Tomba di Rotari, costruzione originaria dell'XI secolo, e l'adiacente chiesa di Santa Maria Maggiore. Negli spazi dell'ex convento trecentesco di San Francesco è stato allestito il Museo delle Arti e Tradizioni Popolari del Gargano, dedicato all'etnologo Giovanni Tancredi.